同时设有「香港口岸离境设施」及「内地口岸的入境设施」；

地下四层（B4）是月台层

西九龙站会在同一层设「内地口岸区」和「香港口岸区」

实施“同层两检”

其中「内地口岸区」范围包括

B2和B3层的划定区域、B4层月台和有关连接通道

建筑楼面面积合计约10.5万平方米

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