单基因干湿结合发4分SCI ?( 二 ) ：单基因干湿结合发4分SCI?今天

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图6.CDCA5与突变特征，拷贝数变异之间的关联
5、CDCA5与miRNA的关系
研究进一步评估了CDCA5上调后miRNA的表达差异。在CDCA5高表达组（以CDCA5-low组为参考，共检测到44个上调的miRNA（≥1.5倍）和113个下调的miRNA（≥1.5倍）。通过使用TargetScan共鉴定了97对miRNA-mRNA相互作用，其中65对在CDCA5表达高的患者中具有显着下调的基因。值得注意的是， hsa-mir-200b负调控了29个基因的表达。 PPI相互作用网络显示，一组癌基因，包括DNMT3A ， TGFB2 ， CXCL12和BCL9 ，可能受到miRNA表达的调控。

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图7.CDCA5表达高、低组患者之间表观遗传变化和基因表达的整合
6、WGCNA评估不同CDCA5患者的DNA甲基化模式
DNA甲基化被认为是调节基因表达的重要表观遗传修饰。先前的研究表明，基因启动子的甲基化CpG岛将抑制基因表达。为了评估CDCA5高、低患者之间的DNA甲基化模式，我们使用WGCNA将甲基化的基因聚类到不同的甲基化模块中。该网络和已识别的模块说明如上图7C 。结果显示， CDCA5上调可能会影响6种癌基因的甲基化状态（图7E），包括TBX3 ， PPP1R14A ， FHL2 ， CAMK1D ， ZBTB16和AKTIP 。在这6个基因中， FHL2 ， CAMK1D和ZBTB16的β值与CDCA5表达呈显着负相关，而PPP1R14A的β值与CDCA5表达呈正相关。
四、小结
作者基于TMA分析的304例HCC患者和TCGA-HCC数据，从miRNA ，突变和WGCNA模块甲基化方面全面分析了CDCA5基因，根据CDCA5表达来评估样品的预后综合分析。结果表明， CDCA5表达与表观遗传变化之间存在关联，阐述了CDCA5上调导致HCC患者较差生存结果的潜在机制，引出CDCA5靶向疗法在未来临床实践中具有潜在价值。